教員情報 - 黒田　誠 | 熊本保健科学大学

1.	2024/04/11	論文	Complete genome sequence of Selenomonas species strain TAMA-11512, isolated from blood culture of a septic patient Microbiol Resour Announc. 13(4),pp.e0007024 （共著）
2.	2024/04/05	論文	Development of a High-Throughput Analytical Method for Antimicrobials in Wastewater Using an Automated Pipetting and Solid-Phase Extraction System Antibiotics (Basel) 13(4),pp.335 （共著）
3.	2024/03/22	論文	Rapid response to a COVID-19 outbreak at a nightclub in Kagoshima prefecture, Japan, in the early phase of the COVID-19 pandemic, June and July 2020: A descriptive epidemiological study J Infect Chemother . S1341-321X(24),pp.98-99 （共著）
4.	2023/11/27	論文	Comparative pathogenomic analysis reveals a highly tetanus toxin-producing clade of Clostridium tetani isolates in Japan mSphere （共著）
5.	2023/11/17	論文	Whole genome sequencing and pan-genome analysis of Staphylococcus/Mammaliicoccus spp. isolated from diabetic foot ulcers and contralateral healthy skin of Algerian patients BMC Microbiol （共著）
6.	2023/11/01	論文	Impact of COVID-19 and closed transmission of SARS-CoV-2 during the first wave in Toyama Prefecture, Japan, March 30 to May 18, 2020 Jpn J Infect Dis （共著）
7.	2023/10/28	論文	Pet Animals Were Infected with SARS-CoV-2 from Their Owners Who Developed COVID-19: Case Series Study Viruses （共著）
8.	2023/10/03	論文	SARS-CoV-2 Infection in Wrestlers after International Tournaments, April 2021 Emerg Infect Dis （共著）
9.	2023/09/28	論文	Molecular Evolutionary Analyses of the Spike Protein Gene and Spike Protein in the SARS-CoV-2 Omicron Subvariants Microorganisms （共著）
10.	2023/08/31	論文	Transmission dynamics variability of lineage 2 Mycobacterium tuberculosis strains in Kobe, Japan, determined using population-based whole-genome sequencing analysis Infect Genet Evol （共著）
11.	2023/08/04	論文	Genomic analysis of SARS-CoV-2 in forensic autopsy cases of COVID-19 J Med Virol （共著）
12.	2023/07/26	論文	Rapid identification of bacteria using a multiplex polymerase chain reaction system for acute abdominal infections Front Microbiol （共著）
13.	2023/07/20	論文	Outbreaks of Campylobacteriosis Caused by Drinking Raw Milk in Japan: Evidence of Relationship Between Milk and Patients by Using Whole Genome Sequencing Foodborne Pathog Dis （共著）
14.	2023/07/11	論文	Multiplex Hybrid Capture Improves the Deep Detection of Antimicrobial Resistance Genes from Wastewater Treatment Plant Effluents to Assess Environmental Issues Microb Drug Resist （共著）
15.	2023/05/27	論文	Performance of a Pilot-Scale Continuous Flow Ozone-Based Hospital Wastewater Treatment System Antibiotics (Basel) （共著）
16.	2023/05/24	論文	Highly sensitive detection of antimicrobial resistance genes in hospital wastewater using the multiplex hybrid capture target enrichment mSphere （共著）
17.	2023/05/05	論文	SARS-CoV-2 intra-host diversity, antibody response, and disease severity after reinfection by the variant of concern Gamma in Brazil Sci Rep （共著）
18.	2023/05/03	論文	Complete Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans Strain TSU-28, Harboring Two Diphtheria Toxin Genes, Isolated from a Patient with Diphtheria-Like Symptoms Microbiol Resour Announc （共著）
19.	2023/03/06	論文	Antimicrobial resistance profiles of Campylobacter jejuni and Salmonella spp. isolated from enteritis patients in Japan J Vet Med Sci （共著）
20.	2023/02/25	論文	Emergence of BS.1 and BS.1.1, highly mutated new SARS-CoV-2 Omicron variants J Med Virol （共著）
21.	2022/10/27	論文	Comprehensive Genome and Plasmidome Analysis of Antimicrobial Resistant Bacteria in Wastewater Treatment Plant Effluent of Tokyo Antibiotics (Basel) （共著）
22.	2022/09/17	論文	Recombination between SARS-CoV-2 Omicron BA.1 and BA.2 variants identified in a traveller from Nepal at the airport quarantine facility in Japan. （共著）
23.	2022/09/08	論文	Independent evolution of multi-dominant viral genome species observed in a hepatitis C virus carrier Biochem Biophys Rep （共著）
24.	2022/08/30	論文	Metagenomic Analysis of Urban Wastewater Treatment Plant Effluents in Tokyo Infect Drug Resist （共著）
25.	2022/07/31	論文	Detection of SARS-CoV-2 Genome for over 100 Days after COVID-19 Onset Jpn J Infect Dis （共著）
26.	2022/07/27	論文	Inactivation of Bacteria and Residual Antimicrobials in Hospital Wastewater by Ozone Treatment Antibiotics (Basel) （共著）
27.	2022/05/09	論文	Singing Is a Risk Factor for Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Infection: A Case-Control Study of Karaoke-Related Coronavirus Disease 2019 Outbreaks in 2 Cities in Hokkaido, Japan, Linked by Whole Genome Analysis Open Forum Infect Dis （共著）
28.	2022/04/20	論文	Recombination between SARS-CoV-2 Omicron BA.1 and BA.2 variants identified in a traveller from Nepal at the airport quarantine facility in Japan J Travel Med （共著）
29.	2022/03/01	論文	Genome Recombination between the Delta and Alpha Variants of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Jpn J Infect Dis （共著）
30.	2022/02/26	論文	Epidemiology and Genetic Analysis of SARS-CoV-2 in Myanmar during the Community Outbreaks in 2020 Viruses （共著）
31.	2022/02/22	論文	Correction to: Quick detection of causative bacteria in cases of acute cholangitis and cholecystitis using a multichannel gene autoanalyzer Surg Today （共著）
32.	2022/01/07	論文	A lethal mouse model for evaluating vaccine-associated enhanced respiratory disease during SARS-CoV-2 infection Sci Adv （共著）
33.	2022/01/05	論文	Comprehensive Genomic Survey of Antimicrobial-Resistance Bacteria in the Sewage Tank Replacement with Hospital Relocation Infect Drug Resist （共著）
34.	2021/12/24	論文	Antimicrobial Resistance in Salmonella Isolated from Food Workers and Chicken Products in Japan Antibiotics (Basel) （共著）
35.	2021/12/13	論文	Corrigendum to: Phylogenetic Analysis Revealed the Dissemination of Closely Related Epidemic Vibrio cholerae O1 Isolates in Laos, Thailand, and Vietnam Open Forum Infect Dis （共著）
36.	2021/11/15	論文	Genomic Epidemiology Reveals Multiple Introductions of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 in Niigata City, Japan, Between February and May 2020 Front Microbiol （共著）
37.	2021/10/04	論文	Transmission of SARS-CoV-2 during a 2-h domestic flight to Okinawa, Japan, March 2020 Influenza Other Respir Viruses （共著）
38.	2021/09/21	論文	[SARS-CoV-2 genomics and its application to genome surveillance] Uirusu （単著）
39.	2021/09/11	論文	A SARS-CoV-2 antibody broadly neutralizes SARS-related coronaviruses and variants by coordinated recognition of a virus-vulnerable site Immunity （共著）
40.	2021/08/13	論文	SARS-CoV-2 is localized in cardiomyocytes: a postmortem biopsy case Int J Infect Dis （共著）
41.	2021/08/13	論文	Whole Genome Analysis Detects the Emergence of a Single Salmonella enterica Serovar Chester Clone in Japan's Kanto Region Front Microbiol （共著）
42.	2021/08/12	論文	Characterization of FRI carbapenemase-producing Enterobacter spp. isolated from a hospital and the environment in Osaka, Japan J Antimicrob Chemother （共著）
43.	2021/08/05	論文	A discernable increase in the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 R.1 lineage carrying an E484K spike protein mutation in Japan Infect Genet Evol （共著）
44.	2021/08/04	論文	High attack rate of SARS-CoV-2 infections during a bus tour in Japan J Travel Med （共著）
45.	2021/07/19	論文	Identification of a Recently Dominant Sublineage in Salmonella 4,[5],12:i:- Sequence Type 34 Isolated From Food Animals in Japan Front Microbiol （共著）
46.	2021/07/13	論文	Quick detection of causative bacteria in cases of acute cholangitis and cholecystitis using a multichannel gene autoanalyzer Surg Today （共著）
47.	2021/07/09	論文	Transmission of extended-spectrum cephalosporin-resistant Salmonella harboring a bla(CMY-2)-carrying IncA/C(2) plasmid chromosomally integrated by ISEcp1 or IS26 in layer breeding chains in Japan J Vet Med Sci （共著）
48.	2021/06/02	論文	Identification of SYS1 as a Host Factor Required for Shiga Toxin-Mediated Cytotoxicity in Vero Cells Int J Mol Sci （共著）
49.	2021/04/23	論文	Haplotype Explorer: an infection cluster visualization tool for spatiotemporal dissection of the COVID-19 pandemic G3 (Bethesda) （共著）
50.	2021/03/22	論文	Vitronectin binding protein, BOM1093, confers serum resistance on Borrelia miyamotoi Sci Rep （共著）
51.	2021/02/23	著書	COVID-19 genome surveillance at international airport quarantine stations in Japan. （共著）
52.	2021/02/10	論文	Novel SARS-CoV-2 Variant in Travelers from Brazil to Japan Emerg Infect Dis （共著）
53.	2021/01/23	論文	Emergence of the mcr-1 colistin resistance gene in extended-spectrum β-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae in Taiwan J Glob Antimicrob Resist （共著）
54.	2021/01/14	論文	A Potent anti-Simian Immunodeficiency Virus Neutralizing Antibody Induction Associated with a Germline Immunoglobulin Gene Polymorphism in Rhesus Macaques J Virol （共著）
55.	2021	著書	SARS-CoV-2 ゲノミクスとサーベイランスへの応用ウイルス 70(2) （単著）
56.	2021	著書	SARS-CoV-2 ゲノム解析からわかること感染・炎症・免疫 51(1) （単著）
57.	2020/11/27	論文	Phylogenetic Analysis Revealed the Dissemination of Closely Related Epidemic Vibrio cholerae O1 Isolates in Laos, Thailand, and Vietnam Open Forum Infect Dis （共著）
58.	2020/11/25	論文	COVID-19 genome surveillance at international airport quarantine stations in Japan J Travel Med （共著）
59.	2020/11/19	論文	Dissemination of IncF group F1:A2:B20 plasmid-harbouring multidrug-resistant Escherichia coli ST131 before the acquisition of bla(CTX-M) in Japan J Glob Antimicrob Resist （共著）
60.	2020/11/12	論文	A Genome Epidemiological Study of SARS-CoV-2 Introduction into Japan mSphere （共著）
61.	2020/10/25	論文	First case of molecularly identified and genetically characterized human T-cell leukemia virus type 2 infection in a pregnant woman in non-endemic Japan J Virol Methods （共著）
62.	2020/10/23	論文	Detailed Molecular Interactions of Favipiravir with SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV, and Influenza Virus Polymerases In Silico Microorganisms （共著）
63.	2020/09/18	論文	Disentangling primer interactions improves SARS-CoV-2 genome sequencing by multiplex tiling PCR PLoS One （共著）
64.	2020/09/18	論文	Limitations of Ribotyping as Genotyping Method for Corynebacterium ulcerans Emerg Infect Dis （共著）
65.	2020/09/01	論文	Coinfection with Human Norovirus and Escherichia coli O25:H4 Harboring Two Chromosomal blaCTX-M-14 Genes in a Foodborne Norovirus Outbreak in Shizuoka Prefecture, Japan J Food Prot （共著）
66.	2020/08/28	論文	Periodic Genotype Shifts in Clinically Prevalent Mycoplasma pneumoniae Strains in Japan Front Cell Infect Microbiol （共著）
67.	2020/08/21	論文	Chromobacterium haemolyticum Pneumonia Associated with Near-Drowning and River Water, Japan Emerg Infect Dis （共著）
68.	2020/08/07	論文	Isolation and plasmid characterisation of Salmonella enterica serovar Albany harbouring mcr-5 from retail chicken meat in Japan FEMS Microbiol Lett （共著）
69.	2020/07/30	論文	Haplotype networks of SARS-CoV-2 infections in the Diamond Princess cruise ship outbreak Proc Natl Acad Sci U S A （共著）
70.	2020/06/26	論文	SARS-CoV-2 Genome Analysis of Japanese Travelers in Nile River Cruise Front Microbiol （共著）
71.	2020/06/04	論文	Neurogenic pulmonary edema following febrile status epilepticus in a 22-month-old infant with multiple respiratory virus co-detection: a case report BMC Infect Dis （共著）
72.	2020/06/03	論文	Meningitis and bacteremia by nonhemolytic Group B Streptococcus strain: A whole genome analysis Microbiol Immunol （共著）
73.	2020/05/16	論文	Clinicopathologic and Immunohistochemical Findings from Autopsy of Patient with COVID-19, Japan Emerg Infect Dis （共著）
74.	2020/05/13	論文	Molecular evolution of the capsid (VP1) region in human norovirus genogroup II genotype 3 Heliyon （共著）
75.	2020/05/06	論文	Comparative Genomic Analysis of Third-Generation-Cephalosporin-Resistant Escherichia coli Harboring the bla(CMY-2)-Positive IncI1 Group, IncB/O/K/Z, and IncC Plasmids Isolated from Healthy Broilers in Japan Antimicrob Agents Chemother （共著）
76.	2020/04/24	論文	High expression of JC polyomavirus-encoded microRNAs in progressive multifocal leukoencephalopathy tissues and its repressive role in virus replication PLoS Pathog （共著）
77.	2020/04/18	論文	Bacterial population kinetics in heteroresistant Mycobacterium tuberculosis harbouring rare resistance-conferring mutations in gyrA and rpoB imply an epistatic interaction of mutations in a pre-XDR-TB patient J Antimicrob Chemother （共著）
78.	2020/04/15	著書	微生物ゲノム解析の進化〜感染症の診断や疫学研究などへの応用〜公衆衛生 84(4) （単著）
79.	2020/04/12	論文	Food Workers as a Reservoir of Extended-Spectrum-Cephalosporin-Resistant Salmonella Strains in Japan Appl Environ Microbiol （共著）
80.	2020/03/14	論文	Enhanced isolation of SARS-CoV-2 by TMPRSS2-expressing cells Proc Natl Acad Sci U S A （共著）
81.	2020/03/07	論文	A prolonged multispecies outbreak of IMP-6 carbapenemase-producing Enterobacterales due to horizontal transmission of the IncN plasmid Sci Rep （共著）
82.	2020/03	著書	薬剤耐性菌問題における環境の重要性。水環境学会誌「水環境中の薬剤耐性菌：現状と対策」 81-84頁（単著）
83.	2020/02/29	論文	Characterization of the IncFII-IncFIB(pB171) Plasmid Carrying bla (NDM-5) in Escherichia coli ST405 Clinical Isolate in Japan Infect Drug Resist （共著）
84.	2020/02/25	論文	Truncated Class 1 Integron Gene Cassette Arrays Contribute to Antimicrobial Resistance of Diarrheagenic Escherichia coli Biomed Res Int （共著）
85.	2020/02/01	論文	Identification of a mecA/mecC-positive MRSA ST1-t127 isolate from a racehorse in Japan. （共著）
86.	2020/01/30	論文	Molecular Evolution of the Protease Region in Norovirus Genogroup II Front Microbiol （共著）
87.	2020/01/28	その他	Initiatives for Addressing Antimicrobial Resistance in the Environment Current Situation and Challenges　(US CDC 2019) （共著）
88.	2020/01/10	著書	次世代シークエンサーの細菌検査への応用と展望。臨床病理 67(12) （単著）
89.	2019/12/20	論文	Candidatus Mycoplasma haemohominis in Human, Japan Emerg Infect Dis （共著）
90.	2019/12/18	論文	Flagellum expression and swimming activity by the zoonotic pathogen Escherichia albertii Environ Microbiol Rep （共著）
91.	2019/11/19	論文	High-throughput genotyping of a full voltage-gated sodium channel gene via genomic DNA using target capture sequencing and analytical pipeline MoNaS to discover novel insecticide resistance mutations （共著）
92.	2019/11/15	論文	Complete genome and bimodal genomic structure of the amoebal symbiont Neochlamydia strain S13 revealed by ultra-long reads obtained from MinION J Hum Genet （共著）
93.	2019/11/07	論文	Identification of a mecA/mecC-positive MRSA ST1-t127 isolate from a racehorse in Japan J Antimicrob Chemother （共著）
94.	2019/11/01	論文	IMP-68, a Novel IMP-Type Metallo-β-Lactamase in Imipenem-Susceptible Klebsiella pneumoniae mSphere （共著）
95.	2019/10/16	論文	Evolutionary Analysis of the VP1 and RNA-Dependent RNA Polymerase Regions of Human Norovirus GII.P17-GII.17 in 2013-2017 Front Microbiol （共著）
96.	2019/10/12	論文	Epidemiological Aspects of Escherichia albertii Outbreaks in Japan and Genetic Characteristics of the Causative Pathogen Foodborne Pathog Dis （共著）
97.	2019/10/10	論文	Clade II Candida auris possess genomic structural variations related to an ancestral strain PLoS One （共著）
98.	2019/10/05	論文	Complete Genome Sequence of an Enterohemorrhagic Escherichia coli O111:H8 Strain Recovered from a Large Outbreak in Japan Associated with Consumption of Raw Beef Microbiol Resour Announc （共著）
99.	2019/09/25	論文	Aseptic meningitis caused by torque teno virus in an infant: a case report J Med Case Rep （共著）
100.	2019/09/08	論文	Whole-genome sequencing-based epidemiological analysis of anti-tuberculosis drug resistance genes in Japan in 2007: Application of the Genome Research for Asian Tuberculosis (GReAT) database Sci Rep （共著）
101.	2019/09/03	論文	IS256-Mediated Overexpression of the WalKR Two-Component System Regulon Contributes to Reduced Vancomycin Susceptibility in a Staphylococcus aureus Clinical Isolate Front Microbiol （共著）
102.	2019/08/28	論文	Rapid and affordable size-selected PacBio single-molecule real-time sequencing template library construction using the bead-beating DNA extraction method J Biol Methods （共著）
103.	2019/08/16	論文	Characterization of NDM-5- and CTX-M-55-coproducing Escherichia coli GSH8M-2 isolated from the effluent of a wastewater treatment plant in Tokyo Bay Infect Drug Resist （共著）
104.	2019/07/31	論文	The genome sequence of Streptomyces rochei 7434AN4, which carries a linear chromosome and three characteristic linear plasmids Sci Rep （共著）
105.	2019/06/20	論文	Enterohaemorrhagic Escherichia coli O121:H19 acquired an extended-spectrum β-lactamase gene during the development of an outbreak in two nurseries Microb Genom （共著）
106.	2019/06/19	論文	Salmonella Genomic Island 3 Is an Integrative and Conjugative Element and Contributes to Copper and Arsenic Tolerance of Salmonella enterica Antimicrob Agents Chemother （共著）
107.	2019/05/24	論文	The R2TP complex regulates paramyxovirus RNA synthesis PLoS Pathog （共著）
108.	2019/05/21	論文	A CRISPR Screen Using Subtilase Cytotoxin Identifies SLC39A9 as a Glycan-Regulating Factor iScience （共著）
109.	2019/05/21	論文	Potential KPC-2 carbapenemase reservoir of environmental Aeromonas hydrophila and Aeromonas caviae isolates from the effluent of an urban wastewater treatment plant in Japan Environ Microbiol Rep （共著）
110.	2019/03/01	論文	Overcoming the pitfalls of automatic interpretation of whole genome sequencing data by online tools for the prediction of pyrazinamide resistance in Mycobacterium tuberculosis PLoS One （共著）
111.	2019/01/21	論文	A CRISPR Screen Identifies LAPTM4A and TM9SF Proteins as Glycolipid-Regulating Factors iScience （共著）
112.	2019/01/09	論文	Molecular Evolutionary Analyses of the RNA-Dependent RNA Polymerase Region in Norovirus Genogroup II Front Microbiol （共著）
113.	2018/12/12	論文	The plasmid-encoded transcription factor ArdK contributes to the repression of the IMP-6 metallo-β-lactamase gene blaIMP-6, leading to a carbapenem-susceptible phenotype in the blaIMP-6-positive Escherichia coli strain A56-1S PLoS One （共著）
114.	2018/12/08	論文	Complete Genome Sequence of bla (IMP-6)-Positive Metakosakonia sp. MRY16-398 Isolate From the Ascites of a Diverticulitis Patient Front Microbiol （共著）
115.	2018/11/10	論文	Complete Genome Sequence and Characterization of Linezolid-Resistant Enterococcus faecalis Clinical Isolate KUB3006 Carrying a cfr(B)-Transposon on Its Chromosome and optrA-Plasmid Front Microbiol （共著）
116.	2018/11/10	論文	Genome-wide association study of cervical cancer suggests a role for ARRDC3 gene in human papillomavirus infection Hum Mol Genet （共著）
117.	2018/11/02	論文	Study on the Outbreak of Human Rhinovirus Species C Infection in a Welfare Facility in Fukuoka Prefecture, Japan Jpn J Infect Dis （共著）
118.	2018/10/22	論文	IncFII plasmid carrying antimicrobial resistance genes in Shigella flexneri: Vehicle for dissemination J Glob Antimicrob Resist （共著）
119.	2018/10/13	論文	Emergence of an Escherichia coli strain co-harbouring mcr-1 and bla(NDM-9) from a urinary tract infection in Taiwan J Glob Antimicrob Resist （共著）
120.	2018/10/13	論文	Insight into the draft whole-genome sequence of the dermatophyte Arthroderma vanbreuseghemii Sci Rep （共著）
121.	2018/09/21	論文	Complete Genome Sequence of a bla(KPC-2)-Positive Klebsiella pneumoniae Strain Isolated from the Effluent of an Urban Sewage Treatment Plant in Japan mSphere （共著）
122.	2018/08/18	論文	Conventional culture methods with commercially available media unveil the presence of novel culturable bacteria Gut Microbes （共著）
123.	2018/08/17	論文	Next-generation DNA sequencing analysis of two Streptococcus suis ST28 isolates associated with human infective endocarditis and meningitis in Gunma, Japan: a case report Infect Dis (Lond) （共著）
124.	2018/07/31	論文	FRI-4 carbapenemase-producing Enterobacter cloacae complex isolated in Tokyo, Japan J Antimicrob Chemother （共著）
125.	2018/07/22	論文	Infection of Epstein⁻Barr Virus in Type III Latency Modulates Biogenesis of Exosomes and the Expression Profile of Exosomal miRNAs in the Burkitt Lymphoma Mutu Cell Lines Cancers (Basel) （共著）
126.	2018/07/07	論文	Prevention of aerosol isolation of nontuberculous mycobacterium from the patient's bathroom ERJ Open Res （共著）
127.	2018/06/01	論文	Erratum: AIG1 affects in vitro and in vivo virulence in clinical isolates of Entamoeba histolytica PLoS Pathog （共著）
128.	2018/05/11	論文	Critical knowledge gaps and research needs related to the environmental dimensions of antibiotic resistance Environ Int （共著）
129.	2018/04/08	論文	Decrease in the prevalence of extended-spectrum cephalosporin-resistant Salmonella following cessation of ceftiofur use by the Japanese poultry industry Int J Food Microbiol （共著）
130.	2018/03/20	論文	AIG1 affects in vitro and in vivo virulence in clinical isolates of Entamoeba histolytica PLoS Pathog （共著）
131.	2018/03/02	論文	Phylogenetic Characterization of Salmonella enterica Serovar Typhimurium and Its Monophasic Variant Isolated from Food Animals in Japan Revealed Replacement of Major Epidemic Clones in the Last 4 Decades J Clin Microbiol （共著）
132.	2018/02/07	論文	Detailed genetic analyses of the HN gene in human respirovirus 3 detected in children with acute respiratory illness in the Iwate Prefecture, Japan Infect Genet Evol （共著）
133.	2018/02/07	論文	Genetic Analysis of Human Norovirus Strains in Japan in 2016-2017 Front Microbiol （共著）
134.	2018/02/03	論文	A summary of the imported cases of Chikungunya fever in Japan from 2006 to June 2016 J Travel Med （共著）
135.	2018/01/14	論文	Novel endogenous simian retroviral integrations in Vero cells: implications for quality control of a human vaccine cell substrate Sci Rep （共著）
136.	2018	著書	「メタゲノム解析による病原体検出」最新医学社「最新医学」 73(4) （単著）
137.	2018	著書	「次世代シークエンサーによる病原体ゲノム網羅解析と感染症の原因究明」感染制御と予防衛生 2(1),1-1頁（単著）
138.	2018	著書	「次世代シークエンサーによる病原体検索と感染症診断のシンポ」先端医学社：「分子呼吸器病」 22(1) （単著）
139.	2018	著書	「次世代シークエンサーを用いた感染症診断の最新事情[No.15]」病理と臨床 36 （単著）
140.	2017/12/28	論文	Isolation and Complete Genome Sequencing of Zika Virus Imported from the Dominican Republic to Japan Jpn J Infect Dis （共著）
141.	2017/12/21	論文	Molecular Evolution of the VP1 Gene in Human Norovirus GII.4 Variants in 1974-2015 Front Microbiol （共著）
142.	2017/12/21	論文	Phylogeny and Immunoreactivity of Norovirus GII.P16-GII.2, Japan, Winter 2016-17 Emerg Infect Dis （共著）
143.	2017/12/20	論文	Streptococcal toxic shock syndrome caused by the dissemination of an invasive emm3/ST15 strain of Streptococcus pyogenes BMC Infect Dis （共著）
144.	2017/12/08	論文	Characterization of Fusobacterium varium Fv113-g1 isolated from a patient with ulcerative colitis based on complete genome sequence and transcriptome analysis （共著）
145.	2017/09/02	論文	Interleukin-6-dependent growth in a newly established plasmablastic lymphoma cell line and its therapeutic targets Sci Rep （共著）
146.	2017/08/18	論文	Analysis of multidrug resistant group B streptococci with reduced penicillin susceptibility forming small, less hemolytic colonies PLoS One （共著）
147.	2017/07/14	論文	Proviral Features of Human T Cell Leukemia Virus Type 1 in Carriers with Indeterminate Western Blot Analysis Results J Clin Microbiol （共著）
148.	2017/06/17	論文	Complete Genome Sequences of the p1 Gene Type 2b and 2c Strains Mycoplasma pneumoniae KCH-402 and KCH-405 Genome Announc （共著）
149.	2017/05/06	論文	A Geographically Widespread Outbreak Investigation and Development of a Rapid Screening Method Using Whole Genome Sequences of Enterohemorrhagic Escherichia coli O121 Front Microbiol （共著）
150.	2017/05/06	論文	Comprehensive Diagnosis of Bacterial Infection Associated with Acute Cholecystitis Using Metagenomic Approach Front Microbiol （共著）
151.	2017/04/27	論文	Effects of Flavonoids and Triterpene Analogues from Leaves of Eleutherococcus sieboldianus (Makino) Koidz. 'Himeukogi' in 3T3-L1 Preadipocytes Molecules （共著）
152.	2017/04/21	論文	Elucidation of quantitative structural diversity of remarkable rearrangement regions, shufflons, in IncI2 plasmids Sci Rep （共著）
153.	2017/04/18	論文	Molecular evolution of the fusion protein (F) gene in human respiratory syncytial virus subgroup B Infect Genet Evol （共著）
154.	2017/04	著書	「ヒト病原体ゲノム解析、最近の動向」生体の科学 68(2) （単著）
155.	2017/03/29	論文	Comprehensive pathogen detection associated with four recurrent episodes of Kawasaki disease in a patient during a single year using next-generation sequencing JMM Case Rep （共著）
156.	2017/03/08	論文	Genetic analyses of the fusion protein genes in human parainfluenza virus types 1 and 3 among patients with acute respiratory infections in Eastern Japan from 2011 to 2015 J Med Microbiol （共著）
157.	2017/02/14	論文	Comparative genome analysis of VSP-II and SNPs reveals heterogenic variation in contemporary strains of Vibrio cholerae O1 isolated from cholera patients in Kolkata, India PLoS Negl Trop Dis （共著）
158.	2017/02/10	論文	Next-generation sequencing of miRNAs in clinical samples of Epstein-Barr virus-associated B-cell lymphomas Cancer Med （共著）
159.	2017	著書	「次世代シークエンサー」臨床とウイルス（単著）
160.	2017	著書	「次世代シークエンサーを用いたウイルス検査の未来」小児内科特集：ウイルス感染症（単著）
161.	2016/12/24	論文	Utilizing the Carba NP test as an indicator of expression level of carbapenemase genes in Enterobacteriaceae （共著）
162.	2016/11/30	論文	Characterization of the Pathogenicity of Streptococcus intermedius TYG1620 Isolated from a Human Brain Abscess Based on the Complete Genome Sequence with Transcriptome Analysis and Transposon Mutagenesis in a Murine Subcutaneous Abscess Model Infect Immun （共著）
163.	2016/11/18	論文	Prevalence of Colistin Resistance Gene mcr-1 and Absence of mcr-2 in Escherichia coli Isolated from Healthy Food-Producing Animals in Japan Antimicrob Agents Chemother （共著）
164.	2016/11/01	論文	Deep-Sequence Identification and Role in Virus Replication of a JC Virus Quasispecies in Patients with Progressive Multifocal Leukoencephalopathy J Virol （共著）
165.	2016/09/10	論文	Profile of Exosomal and Intracellular microRNA in Gamma-Herpesvirus-Infected Lymphoma Cell Lines PLoS One （共著）
166.	2016/08/19	論文	Establishing and characterizing a new primary effusion lymphoma cell line harboring Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus Infect Agent Cancer （共著）
167.	2016/07/23	論文	Correction for Rimbara et al., Draft Genome Sequence of Helicobacter fennelliae Strain MRY12-0050, Isolated from a Bacteremia Patient Genome Announc （共著）
168.	2016/07/19	論文	Pathogen profiles and molecular epidemiology of respiratory viruses in Japanese inpatients with community-acquired pneumonia Respir Investig （共著）
169.	2016/07/08	論文	Molecular evolution of the capsid gene in human norovirus genogroup II Sci Rep （共著）
170.	2016/07/05	論文	DGV: Dengue Genographic Viewer Front Microbiol （共著）
171.	2016/07	著書	「公衆衛生および感染症診断に貢献する微生物ゲノム研究の変貌」医学検査のあゆみ 62(7) （単著）
172.	2016/06/22	論文	Repeated fecal microbiota transplantation in a child with ulcerative colitis Pediatr Int （共著）
173.	2016/06/14	論文	Molecular evolution of the fusion protein gene in human respiratory syncytial virus subgroup A Infect Genet Evol （共著）
174.	2016/05/28	論文	Two different dengue virus strains in the Japanese epidemics of 2014 Virus Genes （共著）
175.	2016/05/19	論文	Possible Case of Novel Spotted Fever Group Rickettsiosis in Traveler Returning to Japan from India Emerg Infect Dis （共著）
176.	2016/04/27	論文	Evaluation of Vero-cell-derived simian endogenous retrovirus infection in humans by detection of viral genome in clinicopathological samples and commercialized vaccines and by serology of Japanese general population Vaccine （共著）
177.	2016/04/17	論文	tRNA-Dependent Aminoacylation of an Amino Sugar Intermediate in the Biosynthesis of a Streptothricin-Related Antibiotic Appl Environ Microbiol （共著）
178.	2016/03/19	論文	Acute encephalopathy in an immunocompromised boy with astrovirus-MLB1 infection detected by next generation sequencing J Clin Virol （共著）
179.	2016/03/09	論文	Distribution and Relationships of Antimicrobial Resistance Determinants among Extended-Spectrum-Cephalosporin-Resistant or Carbapenem-Resistant Escherichia coli Isolates from Rivers and Sewage Treatment Plants in India Antimicrob Agents Chemother （共著）
180.	2016/02/13	論文	VirusTAP: Viral Genome-Targeted Assembly Pipeline Front Microbiol （共著）
181.	2016/01/18	論文	Investigation of a plasmid genome database for colistin-resistance gene mcr-1 Lancet Infect Dis （共著）
182.	2015/11/14	論文	TGS-TB: Total Genotyping Solution for Mycobacterium tuberculosis Using Short-Read Whole-Genome Sequencing PLoS One （共著）
183.	2015/09/27	論文	Molecular evolution of the hypervariable region of the attachment glycoprotein gene in human respiratory syncytial virus subgroup B genotypes BA9 and BA10 Infect Genet Evol （共著）
184.	2015/09/05	論文	Molecular Evolution of the Capsid Gene in Norovirus Genogroup I Sci Rep （共著）
185.	2015/09/01	論文	Characterization of the gut microbiota of Kawasaki disease patients by metagenomic analysis Front Microbiol （共著）
186.	2015/08/14	論文	Capsule Switching and Antimicrobial Resistance Acquired during Repeated Streptococcus pneumoniae Pneumonia Episodes J Clin Microbiol （共著）
187.	2015/07/18	論文	Identification of ribonucleotide reductase mutation causing temperature-sensitivity of herpes simplex virus isolates from whitlow by deep sequencing Clin Case Rep （共著）
188.	2015/07/07	論文	The Mitochondrial Genomes of a Myxozoan Genus Kudoa Are Extremely Divergent in Metazoa PLoS One （共著）
189.	2015/07/02	論文	Molecular evolution of haemagglutinin (H) gene in measles virus Sci Rep （共著）
190.	2015/07	著書	ウイルス分野における次世代DNAシーケエンサーの活用「臨床とウイルス」特集号　43/3 （単著）
191.	2015/06	著書	薬剤耐性プラスミドの菌株間伝達や菌種間伝達を考慮したアウトブレイク発生時のプラスミド解析「化学療法の領域」 31(7) （単著）
192.	2015/03/28	論文	GcoGSA-BA: a global core genome SNP analysis for Bacillus anthracis Health Secur （共著）
193.	2015/02/26	論文	Extensive amplification of GI-VII-6, a multidrug resistance genomic island of Salmonella enterica serovar Typhimurium, increases resistance to extended-spectrum cephalosporins Front Microbiol （共著）
194.	2015/02/14	論文	Complete Genome Sequence of a Novel GV.2 Sapovirus Strain, NGY-1, Detected from a Suspected Foodborne Gastroenteritis Outbreak Genome Announc （共著）
195.	2015/02/13	論文	A mutant H3N2 influenza virus uses an alternative activation mechanism in TMPRSS2 knockout mice by loss of an oligosaccharide in the hemagglutinin stalk region J Virol （共著）
196.	2015/02/13	論文	New validated rapid screening methods for identifying Kudoa septempunctata in olive flounder (Paralichthys olivaceus) Jpn J Infect Dis （共著）
197.	2015/02/03	論文	Molecular evolution of the VP1, VP2, and VP3 genes in human rhinovirus species C Sci Rep （共著）
198.	2015/01/28	論文	Outbreak of henipavirus infection, Philippines, 2014 Emerg Infect Dis （共著）
199.	2015/01	著書	病原体ゲノム解析の急速な進歩と細菌学の新たな展開「感染・炎症・免疫」 44(4),374-377頁（単著）
200.	2014/12/16	論文	Complete genome sequence and comparative genomic analysis of Mycobacterium massiliense JCM 15300 in the Mycobacterium abscessus group reveal a conserved genomic island MmGI-1 related to putative lipid metabolism PLoS One （共著）
201.	2014/12/02	論文	Characterization of Antimicrobial Resistance Dissemination across Plasmid Communities Classified by Network Analysis Pathogens （共著）
202.	2014/11/26	論文	Isolation and characterization of an Huh.7.5.1-derived cell clone highly permissive to hepatitis C virus Jpn J Infect Dis （共著）
203.	2014/10/11	論文	Draft Genome Sequence of Rhodococcus erythropolis JCM 6824, an Aurachin RE Antibiotic Producer Genome Announc （共著）
204.	2014/10/07	論文	Molecular evolution of human respiratory syncytial virus attachment glycoprotein (G) gene of new genotype ON1 and ancestor NA1 Infect Genet Evol （共著）
205.	2014/10/01	論文	The genome landscape of the african green monkey kidney-derived vero cell line DNA Res （共著）
206.	2014/09/24	論文	Characterization of blaTEM-52-carrying plasmids of extended-spectrum-β-lactamase-producing Salmonella enterica isolates from chicken meat with a common supplier in Japan Antimicrob Agents Chemother （共著）
207.	2014/09/09	論文	Detection of trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus in a fatal case of myocarditis in a seven-month-old girl Int J Clin Exp Pathol （共著）
208.	2014/09/07	論文	Genetic characterization and comparison of Clostridium botulinum isolates from botulism cases in Japan between 2006 and 2011 Appl Environ Microbiol （共著）
209.	2014/07/26	論文	Whole-Genome Sequence of CMY-2 β-Lactamase-Producing Salmonella enterica Serovar Typhimurium Strain L-3553 Genome Announc （共著）
210.	2014/07/25	論文	An outbreak of acute respiratory infections due to human respiratory syncytial virus in a nursing home for the elderly in Ibaraki, Japan, 2014 Jpn J Infect Dis （共著）
211.	2014/07/22	論文	A food-borne outbreak of gastroenteritis due to genotype G1P[8] rotavirus among adolescents in Japan Microbiol Immunol （共著）
212.	2014/04/22	論文	Amoebal endosymbiont Neochlamydia genome sequence illuminates the bacterial role in the defense of the host amoebae against Legionella pneumophila PLoS One （共著）
213.	2014/04	著書	「メタゲノム解析による次世代型網羅的病原体検出の取り組み」医学書院・検査と技術 Laboratory Practice. 42(4) （単著）
214.	2014/02/22	論文	Role of pathogenicity determinant protein C (PdpC) in determining the virulence of the Francisella tularensis subspecies tularensis SCHU PLoS One （共著）
215.	2014/01/24	論文	MePIC, metagenomic pathogen identification for clinical specimens Jpn J Infect Dis （共著）
216.	2013/12/21	論文	The V protein of canine distemper virus is required for virus replication in human epithelial cells PLoS One （共著）
217.	2013/11/16	論文	Genetic variation of human papillomavirus type 16 in individual clinical specimens revealed by deep sequencing PLoS One （共著）
218.	2013/11/08	論文	Discrimination of Mycobacterium abscessus subsp. massiliense from Mycobacterium abscessus subsp. abscessus in clinical isolates by multiplex PCR J Clin Microbiol （共著）
219.	2013/08/10	論文	Draft Genome Sequence of Helicobacter fennelliae Strain MRY12-0050, Isolated from a Bacteremia Patient Genome Announc （共著）
220.	2013/07	著書	「メタゲノム解析による網羅的病原体検索」感染症内科 1(1) （単著）
221.	2013/06/25	論文	Epidemic myalgia associated with human parechovirus type 3 infection among adults occurs during an outbreak among children: findings from Yamagata, Japan, in 2011 J Clin Virol （共著）
222.	2013/06/12	論文	Genetic analysis of attachment glycoprotein (G) gene in new genotype ON1 of human respiratory syncytial virus detected in Japan Microbiol Immunol （共著）
223.	2013/05/28	論文	Molecular evolution of attachment glycoprotein (G) gene in human respiratory syncytial virus detected in Japan 2008-2011 Infect Genet Evol （共著）
224.	2013/02/15	論文	Protochlamydia induces apoptosis of human HEp-2 cells through mitochondrial dysfunction mediated by chlamydial protease-like activity factor PLoS One （共著）
225.	2012/12/05	論文	Molecular evolution of hemagglutinin (H) gene in measles virus genotypes D3, D5, D9, and H1 PLoS One （共著）
226.	2012/11/24	論文	Canine distemper virus with the intact C protein has the potential to replicate in human epithelial cells by using human nectin4 as a receptor Virology （共著）
227.	2012/11/09	論文	Genetic analysis of non-hydrogen sulfide-producing Salmonella enterica serovar typhimurium and S. enterica serovar infantis isolates in Japan J Clin Microbiol （共著）
228.	2012/10/26	論文	Epidemic myalgia in adults associated with human parechovirus type 3 infection, Yamagata, Japan, 2008 Emerg Infect Dis （共著）
229.	2012/10/17	論文	Pathogenic characterization of a cervical lymph node derived from a patient with Kawasaki disease Int J Clin Exp Pathol （共著）
230.	2012/10	著書	遺伝子型別法・タイピング法臨床と微生物 39,501-506頁（単著）
231.	2012/05/16	論文	Corynebacterium ulcerans 0102 carries the gene encoding diphtheria toxin on a prophage different from the C. diphtheriae NCTC 13129 prophage BMC Microbiol （共著）
232.	2012/05	著書	感染性腸炎臨床栄養〜腸管と免疫・栄養〜 120(6),711-716頁（単著）
233.	2012/02/17	論文	Detection of a possible bioterrorism agent, Francisella sp., in a clinical specimen by use of next-generation direct DNA sequencing J Clin Microbiol （共著）
234.	2012/01/28	論文	Identification of Kudoa septempunctata as the causative agent of novel food poisoning outbreaks in Japan by consumption of Paralichthys olivaceus in raw fish Clin Infect Dis （共著）
235.	2011/10/04	論文	Complete sequencing of the bla(NDM-1)-positive IncA/C plasmid from Escherichia coli ST38 isolate suggests a possible origin from plant pathogens PLoS One （共著）
236.	2011/06/29	論文	Characterization of Salmonella enterica serovar Typhimurium isolates harboring a chromosomally encoded CMY-2 beta-lactamase gene located on a multidrug resistance genomic island Antimicrob Agents Chemother （共著）
237.	2011/03/25	論文	The impact of Saffold cardiovirus in patients with acute respiratory infections in Yamagata, Japan Scand J Infect Dis （共著）
238.	2011/02/01	論文	Crystal structure of the functional region of Uro-adherence factor A from Staphylococcus saprophyticus reveals participation of the B domain in ligand binding Protein Sci （共著）
239.	2011/01/18	論文	Inhibition of Streptococcus mutans biofilm formation by Streptococcus salivarius FruA Appl Environ Microbiol （共著）
240.	2011	著書	「超高速シークエンサーによる病原体検索」化学療法の領域 27(9) （単著）
241.	2011	著書	次世代シークエンサーで変わる臨床ゲノム学 “変貌する感染症研究” 医学のあゆみ 236(6) （単著）
242.	2010/11/25	論文	Whole-genome analysis of Salmonella enterica serovar Typhimurium T000240 reveals the acquisition of a genomic island involved in multidrug resistance via IS1 derivatives on the chromosome Antimicrob Agents Chemother （共著）
243.	2010/06/18	論文	Genome-wide single nucleotide polymorphism typing method for identification of Bacillus anthracis species and strains among B. cereus group species J Clin Microbiol （共著）
244.	2010/04/30	論文	Characterization of quasispecies of pandemic 2009 influenza A virus (A/H1N1/2009) by de novo sequencing using a next-generation DNA sequencer PLoS One （共著）
245.	2010/04/14	論文	Genomewide screening for novel genetic variations associated with ciprofloxacin resistance in Bacillus anthracis Antimicrob Agents Chemother （共著）
246.	2010/01/23	論文	The first autopsy case of pandemic influenza (A/H1N1pdm) virus infection in Japan: detection of a high copy number of the virus in type II alveolar epithelial cells by pathological and virological examination Jpn J Infect Dis （共著）
247.	2009/11/17	論文	Phylogenetic typing of Bacillus anthracis isolated in Japan by multiple locus variable-number tandem repeats and the comprehensive single nucleotide polymorphism J Vet Med Sci （共著）
248.	2008/12/18	論文	Novel virus discovery in field-collected mosquito larvae using an improved system for rapid determination of viral RNA sequences (RDV ver4.0) Arch Virol （共著）
249.	2008/11/06	論文	Staphylococcus aureus surface protein SasG contributes to intercellular autoaggregation of Staphylococcus aureus Biochem Biophys Res Commun （共著）
250.	2008/09/06	論文	Electron microscopy and computational studies of Ebh, a giant cell-wall-associated protein from Staphylococcus aureus Biochem Biophys Res Commun （共著）
251.	2008/08/01	論文	Structural basis for multimeric heme complexation through a specific protein-heme interaction: the case of the third neat domain of IsdH from Staphylococcus aureus J Biol Chem （共著）
252.	2008/07/22	論文	Staphylococcus aureus giant protein Ebh is involved in tolerance to transient hyperosmotic pressure Biochem Biophys Res Commun （共著）
253.	2008/06/10	論文	Expression, purification, crystallization and preliminary diffraction analysis of CapF, a capsular polysaccharide-synthesis enzyme from Staphylococcus aureus Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun （共著）
254.	2008/03/26	論文	Methicillin-resistant Staphylococcus saprophyticus isolates carrying staphylococcal cassette chromosome mec have emerged in urogenital tract infections Antimicrob Agents Chemother （共著）
255.	2008/03/13	論文	A helical string of alternately connected three-helix bundles for the cell wall-associated adhesion protein Ebh from Staphylococcus aureus Structure （共著）
256.	2007/08/08	論文	Crystal structure analysis reveals a novel forkhead-associated domain of ESAT-6 secretion system C protein in Staphylococcus aureus Proteins （共著）
257.	2007/06/15	論文	Sesquiterpene farnesol as a competitive inhibitor of lipase activity of Staphylococcus aureus FEMS Microbiol Lett （共著）
258.	2007/02/20	論文	[Looking back one year after the start of "the model project on potentially therapeutic death" situation as a pathologist and organizer of Aichi area] Nihon Geka Gakkai Zasshi （単著）
259.	2007/02/01	論文	Subinhibitory concentrations of beta-lactam induce haemolytic activity in Staphylococcus aureus through the SaeRS two-component system FEMS Microbiol Lett （共著）
260.	2007/01/24	論文	Sesquiterpene farnesol inhibits recycling of the C55 lipid carrier of the murein monomer precursor contributing to increased susceptibility to beta-lactams in methicillin-resistant Staphylococcus aureus J Antimicrob Chemother （共著）
261.	2006/06/20	論文	[Whole genome sequence analysis reveals staphylococcal pathogenesis and antimicrobial resistance] Nihon Saikingaku Zasshi （単著）
262.	2006/06	著書	ブドウ球菌属のゲノム解析とゲノムから見える薬剤耐性・病原因子の解析日本細菌学雑誌 61(2),235-241頁（単著）
263.	2006/05/16	論文	Evaluation of a cefoxitin disk diffusion test for the detection of mecA-positive methicillin-resistant Staphylococcus saprophyticus Int J Antimicrob Agents （共著）
264.	2005/10/21	論文	Whole-genome sequencing of staphylococcus haemolyticus uncovers the extreme plasticity of its genome and the evolution of human-colonizing staphylococcal species J Bacteriol （共著）
265.	2005/09/02	論文	Whole genome sequence of Staphylococcus saprophyticus reveals the pathogenesis of uncomplicated urinary tract infection Proc Natl Acad Sci U S A （共著）
266.	2004/05/19	論文	Genome sequencing and annotation: an overview Methods Mol Biol （共著）
267.	2004/05/15	論文	Nucleotide substitutions in Staphylococcus aureus strains, Mu50, Mu3, and N315 DNA Res （共著）
268.	2003/07/17	論文	Two-component system VraSR positively modulates the regulation of cell-wall biosynthesis pathway in Staphylococcus aureus Mol Microbiol （共著）
269.	2003	著書	Chapter "Genome sequencing and annotation: an overview" in Genomics, Proteomincs　and Clinical Bacteriology. （共著）
270.	2002/06/05	論文	Genome and virulence determinants of high virulence community-acquired MRSA Lancet （共著）
271.	2002	著書	Application of Genomic Information to the Diagnosis, Management and Control of Bacterial Infections: Staphylococcus aureus model. Diagnostic Molecular Microbiology 2nd Ed. D. （共著）
272.	2002	著書	Genomics, Proteomincs　and Clinical Bacteriology. Humana Press Inc. (2003) Application of Genomic Information to the Diagnosis, Management and Control of Bacterial Infections: Staphylococcus aureus model. 29-45頁（共著）
273.	2001/06/22	論文	Whole genome sequencing of meticillin-resistant Staphylococcus aureus Lancet （共著）
274.	2000	著書	バンコマイシン耐性黄色ブドウ球菌の薬剤耐性機構蛋白質・核酸・酵素 45,1329-1338頁（共著）
275.	1999/05/06	論文	Chromosome-determined zinc-responsible operon czr in Staphylococcus aureus strain 912 Microbiol Immunol （共著）
276.	1999/04/01	論文	The hsp operons are repressed by the hrc37 of the hsp70 operon in Staphylococcus aureus Microbiol Immunol （共著）
277.	1996/09/24	論文	Atomic force microscopy proposes a novel model for stem-loop structure that binds a heat shock protein in the Staphylococcus aureus HSP70 operon Biochem Biophys Res Commun （共著）
278.	1995/02/27	論文	Isolation and the gene cloning of an alkaline shock protein in methicillin resistant Staphylococcus aureus Biochem Biophys Res Commun （共著）
279.	1994/08/01	論文	Molecular cloning of two new heat shock genes related to the hsp70 genes in Staphylococcus aureus J Bacteriol （共著）
280.	1993/06/15	論文	Molecular characterization of the gene operon of heat shock proteins HSP60 and HSP10 in methicillin-resistant Staphylococcus aureus Biochem Biophys Res Commun （共著）
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■ 学会発表

1.		A unique genome feature of an amoebal endosymbiotic primitive chlamydia, Neochlamydia, showing intimate mutualistic interaction with Acanthamoeba.（113th ASM general meeting.）
2.		An Alkaline Shock Protein and its Regulation in Staphylococcus aureus.（The 95th General Meeting of American Society for Microbiology,）
3.		An Alkaline Shock Protein and its Regulation in Staphylococcus aureus.（Stress Response and Molecular Chaperones, The 10th Rinshoken International Conference）
4.		Analysis of the 16S rRNA gene of the streptomycin-dependent Mycobacterium tuberculosis strain18b and phenotypic revertant strains.（第34回分子生物学会年会）
5.		Antimicrobial Susceptibility Profiles and PFGE Typing of Campylobacter jejuni Isolated from Various Sources in Japan.（the 16th International Workshop on Campylobacter, Helicobacter, and Related Organisms.）
6.		Both the C and V proteins of canine distemper virus play essential roles for the virus replication in human epithelial cells.
7.		Characteristic SNPs in Mycobacterium leprae isolated in Japan.（The 18th International Leprosy Congress.）
8.		Characterization of a novel regulator gene to increase beta-lactam resistance in S. aureus.（第76回日本細菌学会総会）
9.		Corynebacterium ulcerans 0102 carries the gene encoding diphtheria toxin on a prophage different from the C. diphtheriae NCTC 13129 prophage.（European Workshop on Bacterial Protein Toxins (ETOX16)）
10.		Department of Bacteriology, Juntendo University, Tokyo　National Institute of Technology and Evaluation, Sendai,（Comparative genomics and evolution of Staphylococcus aureus, epidermidis and haemolyticus Genomes 2004）
11.		DNAマイクロアレイの利用法（第２２回日本細菌学会技術講習会）
12.		Expression profiles of KSHV-encoded miRNAs in KSHV-associated diseases.（2012 International Congress on Oncogenic Herpesviruses and Associated Diseases.）
13.		Fluctuating gut flora under infectious diseases.（The 3rd International Forum The 98th General Meeting of the Japanese Society of Gastroenterology.）
14.		Identification of the genes associated with glycopeptide-resistance in S.aureus（第77回日本細菌学会総会）
15.		Identification of the Up- and Down-Regulated Genes in Vancomycin-Resistant Staphylococcus aureus Starins Mu3 and Mu50 by cDNA differential Hybridization Method（The 9th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections）
16.		Is1-mediated Horizontal Acquisition Of Multiple Antibiotics Resistance In Salmonella enterica Serovar Typhimurium.
17.		Longitudinal analysis of gut flora in Kawasaki disease patients using a next-generation DNA sequencing.（Scientific conference: Exploring Human Host-Microbiome Interactions in Health and Disease.）
18.		Longitudinal analysis of gut flora in Kawasaki disease patients using next generation DNA sequencing The 10th International Kawasaki Disease Symposium（第10回国際川崎病シンポジウム）
19.		MRSA の産生するSET の機能解析（第86回　日本細菌学会関東支部総会。）
20.		MRSA の産生するSET の機能解析.（第76回　日本細菌学会総会。）
21.		Overexpression of sarA gene affects beta-lactam and glycopeptide susceptibility.（Gordon Research Conference on Staphylococcal Disease）
22.		Regulation of heat and metal responsible czr operon in Staphylococcus aureus.（International conference on dynamics and regulation of the stress response）
23.		S. aureus orf37遺伝子によるHSPオペロンの転写抑制.（日本分子生物学会第20回年会）
24.		S. aureus orf37遺伝子によるHSPオペロンの転写抑制.（日本細菌学会第70回総会）
25.		S. aureusにおいて熱応答する重金属応答遺伝子の解析（日本細菌学会第71回総会）
26.		Spontaneous mutation accompanying decreased growth rate and cell-wall thickening confers vancomycin resistance in the subpopulation of heterogeneously vancomycin-resistant strain Mu3.（ヘテロバンコマイシン耐性における自発的変異蓄積と細胞壁肥厚の解析）（第48回ブドウ球菌研究会）
27.		Streptomycin依存性結核菌における遺伝子変異の解明とStreptomycin耐性をもたらす新たな遺伝子変異（第64回日本細菌学会・中国四国支部会）
28.		The 10th International Kawasaki Disease Symposium（第10回国際川崎病シンポジウム）
29.		VraSR Two-component System Modulates the Expression of the Genes in Cell-Wall Biosynthesis Pathway Including Penicillin-Binding Protein 2 PBP2 and Monofunctional Glycosyltransferase SgtB of Staphylococcus aureus.（The 6th Japan-Korea International Symposium on Microbiology）
30.		VraSR Two-component System Modulates the Expression of the Genes in Cell-Wall Biosynthesis Pathway IncludingPenicillin-Binding Protein 2 PBP2 and Monofunctional Glycosyltransferase SgtB of Staphylococcus aureus.（The 10th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections）
31.		Whole genome sequence of Mycobacteirum massiliense日米医学協力計画　結核・ハンセン病専門部会（第46回日米合同会議）
32.		ストレスにより誘導、抑制されるS. aureus の蛋白.（日本細菌学会第66回総会）
33.		バンコマイシン耐性黄色ブドウ球菌（VRSA）のバンコマイシン耐性関連遺伝子の検索と同定（日本細菌学会第73回総会）
34.		マイクロアレイを用いた黄色ブドウ球菌の抗菌薬の応答解析（日本化学療法学会第50回総会）
35.		マイクロアレイを用いた黄色ブドウ球菌の抗菌薬の応答解析（日本細菌学会第75回総会）
36.		黄色ブドウ球菌S. aureus の染色体に局在する亜鉛耐性遺伝子（第21回　日本分子生物学会年会）
37.		黄色ブドウ球菌のアルカリストレス蛋白質とその発現制御.（日本細菌学会第68回総会）
38.		黄色ブドウ球菌のアルカリストレス蛋白質とその発現調節（日本細菌学会第69回総会）
39.		黄色ブドウ球菌のアルカリストレス蛋白質とその発現調節.（日本分子生物学会第18回年会）
40.		黄色ブドウ球菌のアルカリ性環境で誘導される蛋白質.（日本細菌学会第67回総会）
41.		黄色ブドウ球菌のアルカリ誘導蛋白質とその発現制御.（日本分子生物学会第17回年会）
42.		黄色ブドウ球菌のゲノム解析（日本細菌学会第74回総会）
43.		黄色ブドウ球菌のヘテロバンコマイシン耐性を起こす二成分制御系vraSRの活性化について（第77回日本細菌学会総会）
44.		黄色ブドウ球菌のヘテロバンコマイシン耐性表現型を起こすTwo-component system vraSR の活性化について（第48回ブドウ球菌研究会）
45.		黄色ブドウ球菌の熱ショックにおける新たな応答遺伝子群（日本細菌学会第72回総会）
46.		環境応答性膜蛋白質。（日本生体エネルギー研究会第24回討論会）
47.		嫌気性菌感染が契機と推定される抗中枢神経抗体による自己免疫性脳炎の1例。（第60回小児科関東地方会）
48.		次世代シークエンサーによる川崎病の病原体候補の探索（第31回日本川崎病学会）
49.		新下痢原性寄生虫クドアの発見（第81回日本寄生虫学会）
50.		製品評価技術基盤機構Staphylococcus aureus, epidermidis，haemolyticus の全ゲノム比較と進化（第77回日本細菌学会総会）
51.		川崎病患児における細菌叢の経時的変動解析（第31回日本川崎病学会）
52.		川崎病診断時における血清免疫グロブリンの検討（第31回日本川崎病学会）
53.		多剤耐性ゲノミックアイランドを保有するセファロスポリン耐性Salmonella Typhimuriumの出現（152回日本獣医学学会）
54.		腐性ブドウ球菌Staphylococcus saprophyticus ATCC15305株のゲノム配列と尿路病原因子の特定（第７回ワークショップ　微生物ゲノム研究のフロンティア）
55.		網羅的ゲノム解析によるヒラメ喫食に関連する嘔吐下痢症の原因物質の探索（第16回日本神経感染症学会）
56.		野外分離イヌジステンパーウイルスはイヌおよびヒトnectin4を受容体として利用できるが、麻疹ウイルスと異なりヒト上皮細胞では増殖できない（マイナス鎖RNAウイルス研究会）
57.	2023/03	ESAT-6 like protein secreted via T7SS contributes to cytotoxicity of Streptococcus intermedius.（第96回日本細菌学会総会）
58.	2022/11	SARS-CoV-2のORF7蛋白の機能解析.（第69回ウイルス学会学術集会）
59.	2022/11	新興・再興感染症データバンク事業　ナショナル・リポジトリの構築：COVID-19 患者の生体試料と臨床情報の収集・保管・利活用の現状.（第36回エイズ学会学術集会）
60.	2022/10	原因不明疾患を感染症として理解するためのゲノミクス研究（第26回日本神経感染症学会総会・学術大会）
61.	2022/10	原因不明疾患を感染症として理解するためのゲノミクス研究．（第26回日本神経感染症学会総会・学術大会）
62.	2022/10	新型コロナウイルスの世界的な変異追跡と公衆衛生への利活用〜何を理解し何が分からないのか〜（第3回　愛媛ワンヘルス研究会）
63.	2022/10	新型コロナウイルスの世界的な変異追跡と公衆衛生への利活用〜何を理解し何が分からないのか〜（第3回　愛媛ワンヘルス研究会）
64.	2022/09	Effectiveness of Enhanced Active Case Finding and Self-isolation in the Early Phase of SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron)（variant Transmission - Osaka, Japan, December 2021-January 2022. 11th Global Scientific Conference）
65.	2022/09	患者・家畜・食品・環境由来サルモネラのSNVs解析.（第43回日本食品微生物学会学術総会）
66.	2022/06	オゾンマイクロバブル処理による病院汚水の薬剤耐性菌、残留抗菌薬の低減.（第70回日本化学療法学会総会）
67.	2022/03	Comparative genomic analysis of clinical and wastewater isolates of carbapenemase- and extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacterales from a tertiary care hospital in northeast Japan.
68.	2022/03	ESAT-6 like protein contributes to T7SS-dependent cytotoxicity in Streptococcus intermedius.（第95回日本細菌学会総会）
69.	2022/03	熊本県内土壌中の破傷風菌の分布調査と分離菌の細菌学的、遺伝子学的解析.（第95回日本細菌学会総会）
70.	2022/02	新型コロナウイルスのゲノムサーベイランスによる公衆衛生対策（福岡県”One Health”国際フォーラム2022）
71.	2022/02	新型コロナウイルスのゲノムサーベイランスによる公衆衛生対策（福岡県”One Health”国際フォーラム2022）
72.	2021/12	新型コロナゲノム・サーベイランスから示唆される公衆衛生対策への利活用（第80回日本公衆衛生学会総会）
73.	2021/12	新型コロナゲノム・サーベイランスから示唆される公衆衛生対策への利活用（第80回日本公衆衛生学会総会）
74.	2021/11	新型コロナウイルスのゲノムサーベイランスと公衆衛生対策への利活用（第68回日本ウイルス学会学術集会　日本臨床ウイルス学会共催シンポジウム）
75.	2021/11	新型コロナウイルスのゲノムサーベイランスと公衆衛生対策への利活用（第68回日本ウイルス学会学術集会　日本臨床ウイルス学会共催シンポジウム）
76.	2021/10	新型コロナウイルスのゲノム情報を利活用したサーベイランスと公衆衛生対策（第65回日本医真菌学会総会）
77.	2021/10	新型コロナウイルスのゲノム情報を利活用したサーベイランスと公衆衛生対策（第65回日本医真菌学会総会）
78.	2021/07	肺抗酸菌症由来臨床検体のメタゲノムによるフローラ解析（第127回日本結核・非結核性抗酸菌症学会近畿支部学会）
79.	2021/05	新型コロナウイルスSARS-CoV-2ゲノム情報による分子疫学解析〜 Variants of concern の特徴〜（第 95 回日本感染症学会学術講演会/第 69 回日本化学療法学会総会合同学会緊急シンポジウム）
80.	2021/05	新型コロナウイルスSARS-CoV-2ゲノム情報による分子疫学解析〜 Variants of concern の特徴〜（第 95 回日本感染症学会学術講演会/第 69 回日本化学療法学会総会合同学会緊急シンポジウム）
81.	2021/04	ナミカ亜科用汎用的SNP解析プローブの開発.（第73回　衛生動物学会大会）
82.	2021/03	Streptococcus intermediusの病原性における7型分泌装置の特性解析（第94回日本細菌学会総会）
83.	2021/03	東京における下水処理排水のメタゲノムおよびレジストーム解析（第94回日本細菌学会総会）
84.	2021/03	病原細菌ゲノム情報データベースGlobal Genome Epidemiology Database (gGENEPID)によるゲノム情報支援（第94回日本細菌学会総会）
85.	2020/02	Characterization of the T7SS-dependent cytotoxicity in Streptococcus intermedius pathogenicity.（第93回日本細菌学会総会）
86.	2020/02	Streptomycin dependent Mycobacterium bovis BCG possessing a 513 cytosine insertion in 16S rRNA gene（第93回日本細菌学会総会）
87.	2020/02	ゲノミクスを用いた環境中の薬剤耐性菌問題への取り組み（第93回日本細菌学会総会）
88.	2020/02	ニホンサシチョウバエ共生リケッチアの完全長ゲノムアセンブリ．（第93回日本細菌学会総会）
89.	2020/02	ヒト・口腔常在フローラ内でのStreptococcus intermediusの生存戦略解析（第93回日本細菌学会総会）
90.	2020/02	我が国における単相変異型Salmonella Typhimuriumの小進化（第93回日本細菌学会総会）
91.	2020/02	細菌ゲノミクスを支援する Global Genome Epidemiology Database（gGENEPID）の開発（第93回日本細菌学会総会）
92.	2019/12	ゲノムワイドCRISPR/Cas9スクリーニングシステムのin silico解析webアプリケーション（第42回日本分子生物学会年会）
93.	2019/09	CHARACTERIZATION OF THE CYTOTOXICITY BY STREPTOCOCCUS INTERMEDIUS TYPE SEVEN SECRETION SYSTEM.（MICROBIAL PATHOGENESIS & HOST RESPONSE）
94.	2019/09	ブロイラー由来第3世代セファロスポリン耐性大腸菌が保有するblaCMY-2陽性IncI1、IncB/O/K/Z及びIncA/C2の海外由来株との比較解析（第162回日本獣医学会学術集会）
95.	2019/08	Genome-wide CRISPR screens identify novel glycan regulators.（25th International Symposium on Glycoconjugates）
96.	2019/08	ゲノムワイドスクリーニングによって同定された糖鎖発現制御因子の解析（第38回日本糖質学会年会）
97.	2018/11	Salmonella genomic island 3はintegrative and conjugative elementであり、宿主の重金属抵抗性を増強させる.（日本細菌学会関東支部総会）
98.	2018/11	プラスミド性転写調節因子ArdKによるカルバペネマーゼ遺伝子blaIMP-6転写抑制機序の解析.（第101回日本細菌学会関東支部総会）
99.	2018/11	小児脳膿瘍患者より分離されたStreptococcus intermedius TYG1620株におけるType Seven Secretion Systemの機能解析.（第101回日本細菌学会関東支部総会）
100.	2018/10	A prolonged multispecies outbreak of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae due to transmissible plasmid with carbapenemase gene.（ID week 2018）
101.	2018/10	The R2TP complex modulates viral RNA synthesis of mumps virus.（第66回日本ウイルス学会）
102.	2018/09	Complete genome sequence of a blaKPC-2-positive Klebsiella pneumoniae strain isolated from the effluent of an urban sewage treatment plant in Japan.（ESCMID/ASM Conference on Drug Development to Meet the Challenge of Antimicrobial Resistance）
103.	2018/09	Growth Inhibition of Streptococcaceae in Healthy Gut Flora by Interocin of Streptococcus intermedius TYG1620 Isolated from a Human Brain Abscess.（ESCMID/ASM Conference on Drug Development to Meet the Challenge of Antimicrobial Resistance）
104.	2018/09	Salmonella genomic island 3はintegrative and conjugative elementである.（第１６１回日本獣医学会学術集会）
105.	2018/09	Whole genome analysis of clostridioides difficile strains isolated from horses in Japan.（6th International Clostridium difficile Symposium）
106.	2018/08	The maintenance of antimicrobial resistance genes by multireplicon IncF plasmid F1:A2:B20 in epidemic clone Escherichia coli ST131.（Plasmid Biology 2018）
107.	2018/05	EHEC Working Group Applicability of whole genome sequencing of enterohemorrhagic Escherichia coli O111 in the national surveillance.（VTEC2018 10th International Symposium）
108.	2018/05	潰瘍性大腸炎患者由来Fusobacterium varium Fv113-g1株のゲノム・トランスクリプトーム解析.（22回腸内細菌学会）
109.	2018/03	2007年に全国から収集した結核菌株の全ゲノム解析.（第91回日本細菌学会総会）
110.	2018/03	TGS-TBに実装した結核菌薬剤耐性マーカーの in silico 検出ツールの感受性予測精度の検証.（第91回日本細菌学会総会）
111.	2018/03	「次世代シークエンサーを用いた病原体診断」（57回臨床検査・東海北陸支部会）
112.	2018/03	カルバペネム感性大腸菌におけるプラスミド性転写調節因子ArdKのblaIMP-6発現抑制機序の解析.（第91回日本細菌学会総会）
113.	2018/03	欧州に由来するSalmonella enterica ser. Typhimurium非定型株の国内侵入後の小進化.（第91回日本細菌学会総会）
114.	2018/03	完全長ゲノム配列解析による潰瘍性大腸炎患者より分離されたFusobacterium varium Fv113-g1株の特徴.（第91回日本細菌学会総会）
115.	2018/03	既存培地を用いた健常者便由来新種腸内細菌の分離および同定.（第91回日本細菌学会総会）
116.	2018/03	次世代シークエンサーを用いた病原体診断（57回臨床検査・東海北陸支部会）
117.	2018/03	大腸菌ST131 H30R1に順応したIncF[F1:A2:B20]プラスミドがblaCTX-M-14の安定的保持に関与する.（第91回日本細菌学会総会）
118.	2018/03	比較ゲノム解析から推定されたボレリア属細菌の進化イベント.（第91回日本細菌学会総会）
119.	2018/02	黒田誠「進化し続けるシークエンス技術と公衆衛生・感染症診断への利活用と将来展望」教育講演（日本獣医師会獣医学術学会）
120.	2018/02	進化し続けるシークエンス技術と公衆衛生・感染症診断への利活用と将来展望（教育講演日本獣医師会獣医学術学会）
121.	2017/12	CRISPRライブラリーを用いた糖脂質生合成に影響を及ぼす因子の探索.（2017年生命科学系学会合同年次大会）
122.	2017/11	Antimicrobial Resistance Genetic Marker Prediction for Mycobacterium tuberculosis.（International Congress of Chemotherapy and Infection 2017 (ICC 2017)）
123.	2017/11	メタゲノム解析を用いた急性胆嚢炎の起因菌同定，重症度評価，術中難易度予測に関する有用性の検討.（日本外科感染症学会）
124.	2017/10	Characterization of gut microbiome associated with improvement of ulcerative colitis after antibiotic combination therapy using fecal full metagenomic analysis.（25th United European Gastroenterology Week (UEGW2017)）
125.	2017/10	Transcriptional factor ArdK on IncN plasmid contributes to the repression of blaIMP-6 in concealed-type carbapenem-susceptible Escherichia coli.（Keystone Symposia Conference T4: Antimicrobials and Resistance: Opportunities and Challenges）
126.	2017/10	ゲノム情報から推定されたボレリア属細菌の進化イベント．（第63回日本寄生虫学会・日本衛生動物学会北日本支部合同大会）
127.	2017/10	次世代シークエンサーにより診断に至った稀な合併症である水痘ウイルス性関節炎の女児例.（第49回日本小児感染症学会総会）
128.	2017/10	詳細な検索によりウイルス感染の関与が示された抗NMDA型GluRに対する抗体陽性脳炎の小児3症例.（第22回日本神経感染症学会総会・学術大会）
129.	2017/10	神戸市内で分離されたカンピロバクターの分子疫学解析.（第38回日本食品微生物学会）
130.	2017/10	中国地方にて分離されたDelftia acidovoransが保有するIMP-34プラスミドの解析.（第65回日本化学療法学会西日本支部総会）
131.	2017/09	牛由来Salmonella Typhimurium及びその非定型株（4:i:-）の全ゲノム系統解析と新規遺伝子型別法の構築.（第160回日本獣医学会学術集会）
132.	2017/09	牛由来ネズミチフス菌とその非定型株の分子疫学.（第100回日本細菌学会関東支部総会）
133.	2017/09	次世代シークエンサー（NGS）を利用した健康ブロイラー由来第3世代セファロスポリン耐性大腸菌の分子疫学的解析（第160回日本獣医学会学術集会）
134.	2017/09	養鶏産業におけるセフチオフルの使用自粛と鶏肉由来広域スペクトルセファロスポリン耐性サルモネラの減少.（第160回日本獣医学会学術集会）
135.	2017/07	メタゲノム解析を用いた急性胆嚢炎の起因菌同定，重症度評価，術中予測に関する検討.（第72回消化器外科学会）
136.	2017/07	黒田誠次世代シークエンス技術と公衆衛生・感染症診断への応用（第20回小児心血管分子医学研究会）
137.	2017/07	次世代シークエンス技術と公衆衛生・感染症診断への応用.（第20回小児心血管分子医学研究会）
138.	2017/06	次世代シークエンサーが明らかにしたJCウイルスのゲノム変異とPMLの病態.（第58回日本神経病理学会総会学術研究会）
139.	2017/06	次世代シークエンサーが明らかにしたJCウイルスのゲノム変異とPMLの病態。（第58回日本神経病理学会総会学術研究会）
140.	2017/05	Spreading of the blaCTX-M-8 carrying plasmid in human was mediated by its possessed Escherichia coli contaminated chicken meat; a public health concern.（13th beta-lactamase meeting）
141.	2017/04	Deep-sequence identification and role in virus replication of a JCV quasispecies in PML patients.（第106回日本病理学会総会）
142.	2017/04	Deep-sequence identification and role in virus replication of a JCV quasispecies in PML patients.（第106回日本病理学会総会）
143.	2017/04	Total Genotyping Solution for Mycobacterium tuberculosis (TGS-TB) による結核菌薬剤耐性マーカー検出と感受性予測法の構築.（第65回日本化学療法学会学術総会）
144.	2017/04	パラインフルエンザ３型感染症を契機に診断された若年性関節リウマチの１例.（第120回日本小児科学会学術集会）
145.	2017/04	医療施設で分離されたカルバペネマーゼGES-24産生複数菌種株由来プラスミドのゲノム情報解析.（第65回日本化学療法学会学術総会）
146.	2017/04	急性胆嚢炎迅速診断におけるメタゲノム解析の有用性に関する検討.（第65回日本化学療法学会学術総会）
147.	2017/04	次世代シークエンサーを用いて1型壊死性筋膜炎の複合感染の解析を行った1例.（第91回日本感染症学会学術講演会）
148.	2017/04	進化し続けるシークエンス技術と公衆衛生・感染症診断への応用（第65回日本化学療法学会学術総会）
149.	2017/04	進化し続けるシークエンス技術と公衆衛生・感染症診断への応用（第65回日本化学療法学会学術総会）
150.	2017/04	多剤耐性Acinetobacterが保有するGES-24プラスミドの解析.（第65回日本化学療法学会学術総会）
151.	2017/03	Characterization of the pathogenicity of Streptococcus intermedius.（第89回日本細菌学会）
152.	2017/03	Genomic feature of HTLV-1 in Western blot indeterminate.（18th International Conference on Human Retrovirology HTLV and Related Viruses）
153.	2017/03	IncI2プラスミドに存在する高度組換え領域shufflonの定量的構造多様性の解明。（第89回日本細菌学会）
154.	2017/03	PacBio library作製における迅速かつ簡便な細菌長鎖DNA断片調整法の検討。（第89回日本細菌学会）
155.	2017/03	Prediction tool for drug-resistant genetic marker based on whole genome sequence of TB.（第89回日本細菌学会）
156.	2017/03	アジアの結核菌のゲノムデータベース”GReAT”の構築。（第89回日本細菌学会）
157.	2017/03	既存培地を用いた健常者由来新規腸内細菌の探索および分離。（第89回日本細菌学会）
158.	2017/03	小さいコロニーを形成し低溶血性のPRGBSの解析。（第89回日本細菌学会）
159.	2017/03	腸管出血性大腸菌O111における全ゲノム配列を用いた分子疫学解析。（第89回日本細菌学会）
160.	2017/03	馬パラチフス菌の表現型と偽遺伝子の関連。（第89回日本細菌学会）
161.	2016/12	DGV: Dengue Genographic Viewer.（Joint International Tropical Medicine Meeting 2016 JITMM2016）
162.	2016/10	Application of genome editing technologies for studies on sphingolipid and glycan metabolisms.（EMBO Workshop “Glycosylation in the Golgi complex”）
163.	2016/09	Virus genome-targeted assembly pipeline: VirusTAP.（第5回生命医薬情報学連合大会）
164.	2016/09	ゲノム編集技術を用いたスフィンゴ脂質・糖鎖の代謝研究。（第35回日本糖質学会年会）
165.	2016/09	腸管出血性大腸菌サーベイランスにおける全ゲノム配列解析の有用性評価。（第159回日本獣医学会）
166.	2016/09	馬パラチフス菌の宿主特異性に関する考察。（第159回日本獣医学会）
167.	2016/08	Comparative genome analysis of Staphylococcal Cassette Chromosome (SCC) elements among Staphylococcus saprophyticus, causative agent of uncomplicated urinary tract infections.（17th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections (ISSSI)）
168.	2016/07	Visualizing genotype distribution of dengue virus.（The 11th China-Japan International Conference of Virology）
169.	2016/06	P1遺伝子 2b、2c型のM. pneumoniae 株で見つかった細胞接着関連遺伝子 orf6 の変化。（日本マイコプラズマ学会第43回学術集会）
170.	2016/06	プラスミドネットワーク解析ツールiPAT。（第64回日本化学療法学会総会）
171.	2016/05	Genomic epidemiology of Clostridium botulinum isolates from Japanese Botulism Cases.（9th Meeting on Global Microbial Identifier (GMI)）
172.	2016/03	Streptococcus intermediusのマウス皮下膿瘍における転写調節機構。（第88回日本細菌学会）
173.	2016/03	インドの環境由来β-ラクタム系抗生物質耐性大腸菌における耐性遺伝子の分布。（第88回日本細菌学会）
174.	2016/03	コルカタにおける2007-2014年コレラ流行株の全ゲノム解析によって明らかになったVSP-IIの変化。（第88回日本細菌学会）
175.	2016/03	患者及び食材から分離されたSalmonella Infantis株の次世代シークエンサーによるゲノム系統解析。（第88回日本細菌学会）
176.	2016/03	急性膀胱炎の起因菌Staphylococcus saprophyticus分離株におけるゲノムアイランドSCCの構造比較解析。（第88回日本細菌学会）
177.	2016/03	次世代シークエンスリードによる結核菌ゲノム分子疫学解析ツール。（第88回日本細菌学会）
178.	2016/03	全ゲノム配列を用いた腸管出血性大腸菌O121の散在的集団感染事例の解析。（第88回日本細菌学会）
179.	2016	GenEpid-J: an integrated database of pathogen genomics and epidemiology focused on plasmids involving in the antimicrobial resistance.（Plasmid Biology 2016）
180.	2015/09	Geographical view of dengue genotype distribution. DENGUE SURVEILLANCE:（INFORMATION-SHARING AMONG ASIAN COUNTRIES FOR A BETTER PREPARED REGION）
181.	2015/09	TGS-TB: Total Genotyping Solution for Mycobacterium tuberculosis using short-read whole-genome sequencing.（1st ASM Conference on Rapid NGS Bioinformatic Pipelines for Enhanced Molecular Epidemiologic Investigation of Pathogens）
182.	2015/05	TGS-TB: Total Genotyping Solution for Mycobacterium tuberculosis using short-read whole-genome sequencing.（8th Meeting on Global Microbial Identifier (GMI)）
183.	2015/05	日本人からのTrichodysplasia-spinulosa associated polyomavirusのクローニング。（第114回日本皮膚科学会総会）
184.	2015/03	A single base insertion in 16S rRNA gene confers Streptomycin dependence in Mycobacterium bovis BCG。（第88回日本細菌学会）
185.	2015/03	GcoGSA-BA: NGSデータから炭疽菌のコアゲノム系統解析を行うウェブアプリケーション。（第88回日本細菌学会）
186.	2015/03	IMP-1メタロ-β-ラクタマーゼ保有プラスミドの全塩基配列解読で判明した他菌種の腸内科細菌の院内感染。（第88回日本細菌学会）
187.	2015/03	VI型エフェクター・免疫蛋白質の進化と多様性。（第88回日本細菌学会）
188.	2015/03	サルモネラ 4,5,12:i:-株のゲノム構造および多剤耐性の性状について。（第88回日本細菌学会）
189.	2015/03	抗酸菌におけるパラアミノサリチル酸に対する新たな耐性機序の可能性。（第88回日本細菌学会）
190.	2015/03	小児脳膿瘍から分離された連鎖球菌Streptococcus intermedius TYG1620のゲノム解析。（第88回日本細菌学会）
191.	2015/03	川崎病患者の腸内細菌フローラ解析。（第88回日本細菌学会）
192.	2015/03	日本で分離されたらい菌Kyoto-2の特徴的なゲノタイプ。（第88回日本細菌学会）
193.	2015/03	比較ゲノム解析により明らかとなったMycobacterium massilienseの脂質代謝関連ゲノムアイランド。（第88回日本細菌学会）
194.	2015/02	Human oral, gut and blood microbiota in patients with Kawasaki disease.（International Kawasaki Disease Symposium 2015）
195.	2014/11	II型膜貫通型セリンプロテアーゼTMPRSS2は、HA開裂部位にmono-basicなアミノ酸配列をもつA型インフルエンザウイルスの生体内必須活性化酵素である。（第62回日本ウイルス学会学術集会）
196.	2014/11	次世代シークエンサーによる感染性胃腸炎集団事例患者検体からのサポウイルスGV.2の検出。（第62回日本ウイルス学会学術集会）
197.	2014/11	網羅的ウイルス検出法　multivirus real-time PCRの改良と臨床検体への応用。（第62回日本ウイルス学会学術集会）
198.	2014/10	metKの変異はBCGにパラアミノサリチル酸に対する耐性を附与する。（第67回日本細菌学会中国四国支部総会）
199.	2014/10	Salmonella enterica serovar 4:i:- 株の次世代シークエンサーによるゲノム解析。（第67回日本細菌学会中国四国支部総会）
200.	2014/10	志賀毒素の細胞傷害作用に対するゲノムワイドshRNAスクリーニング。（第87回日本生化学会大会）
201.	2014/10	川崎病患者の末梢血、咽頭・直腸スワブのメタゲノム解析。（第34 回日本川崎病学会・学術集会）
202.	2014/09	Comparison of genome sequences between Mycobacterium leprae prepared before and after passaging in nude mice footpad.（The Join Meeting The XVIII International Symposium on Gnotobiology (XVIII-ISG) III International Ecologic Forum “Environment and human health” (EcoForum)）
203.	2014/09	Isolation and Characterization of A Huh.7.5.1-Derived Cell Clone Highly Permissive to Hepatitis C Virus.（HCV meeting 2014）
204.	2014/09	サルモネラ薬剤耐性アイランド多コピー化の様式解明。（第157回日本獣医学会学術集会。）
205.	2014/09	宿主プロテアーゼTMPRSS2は、インフルエンザウイルスの生体内活性化酵素である。（第157回日本獣医学会学術集会。）
206.	2014/09	多剤耐性Salmonella Typhimuriumのゲノム生物学的特徴。（第157回日本獣医学会学術集会。）
207.	2014/08	原始的なクラミジアNeochlamydia S13が共生するアカントアメーバのレジオネラ撃退機序を解明するための基礎的な検討。（日本細菌学会北海道支部会）
208.	2014/08	比較ゲノム解析から紐解くクラミジアの多様性と進化。（日本細菌学会北海道支部会）
209.	2014/07	2011集団食中毒検体から分離されたStx2ファージの特徴。（第 18 回腸管出血性大腸菌感染症研究会）
210.	2014/07	TMPRSS2 is essential for influenza virus replication in vivo.（International Union of Microbiological Societies (IUMS 2014)）
211.	2014/06	プラスミドームネットワーク解析：プラスミド上の遺伝子水平伝達ネットワーク解析。（第88回日本感染症学会学術講演会第62回日本化学療法学会総会合同学会）
212.	2014/06	小児脳膿瘍から分離された連鎖球菌 Streptococcus intermedius TYG1620 のゲノム解析。（第88回日本感染症学会学術講演会第62回日本化学療法学会総会合同学会）
213.	2014/06	新規 Enterobacter sp. のゲノム解読と染色体性β-lactamase bla MIR-KINAN の解析。（第88回日本感染症学会学術講演会第62回日本化学療法学会総会合同学会）
214.	2014/03/25	Amoebal endosymbiont Neochlamydia restricts Legionella growth in its host amoebae.（The 12th Japan-Korea International Symposium on Microbiology (XII-JKISM).）
215.	2014/03/25	Makoto Kuroda. Metagenomic analysis for the clinical investigation of possible pathogens.（The 12th Japan-Korea International Symposium on Microbiology (XII-JKISM).）
216.	2014/03/25	Metagenomic analysis for the clinical investigation of possible pathogens.（The 12th Japan-Korea International Symposium on Microbiology (XII-JKISM).）
217.	2014/03	II型制限修飾遺伝子をもつStx2プロファージを保有する溶原菌が産生する制限酵素の部分精製。（第87回日本細菌学会）
218.	2014/03	あるアメーバはLegionella感染を回避するためにNeochlamydiaを内部共生させている。（第87回日本細菌学会）
219.	2014/03	らい菌日本分離株で発見された特徴的なSNPsの解析。（第87回日本細菌学会）
220.	2014/03	アシネトバクターの薬剤耐性と拡散メカニズム。（第87回日本細菌学会）
221.	2014/03	サルモネラ病原因子パネルの検討について。（第87回日本細菌学会）
222.	2014/03	プラスミドネットワーク解析：プラスミド上の遺伝子の水平伝播ネットワーク解析。（第87回日本細菌学会）
223.	2014/03	小児脳膿瘍から分離された連鎖球菌Streptococcus intermedius TYG1620のゲノム解析。（第87回日本細菌学会）
224.	2014/03	新規Enterobacter sp.のゲノム解読と染色体性ß-lactamase blaMIR-KINANの解析。（第87回日本細菌学会）
225.	2014/03	馬パラチフス原因菌Salmonella Abortusequiのゲノム生物学的特徴。（第87回日本細菌学会）
226.	2013/12	Comprehensive analysis of horizontal plasmid transfer based on a component network analysis: Plasmidome network analysis.（第３６回日本分子生物学会年会）
227.	2013/11	EBV関連リンパ増殖性疾患におけるウイルスmiRNAの発現プロファイル。（第61回日本ウイルス学会学術集会。）
228.	2013/11	イヌジステンパーウイルスのVタンパクはヒト肺胞上皮細胞でのウイルス増殖において重要な役割を果たす。（第61回日本ウイルス学会学術集会。）
229.	2013/11	単純ヘルペスウイルス臨床分離株の次世代シークエンサーによる変異部位の網羅的解析。（第61回日本ウイルス学会学術集会。）
230.	2013/11	日本人からのTrichodysplasia-spinulosa associated polyomavirusのクローニング。（第61回日本ウイルス学会学術集会。）
231.	2013/10	ミトコンドリアDNAを標的としたナナホシクドア検出法の開発。（第34回日本食品微生物学会総会。）
232.	2013/10	完全長ゲノム配列決定による馬パラチフス菌のゲノム生物学的特徴。（第96回日本細菌学会関東支部総会。）
233.	2013/09	川崎病患者のFFPE肺組織を用いたメタゲノム解析。（第33回日本川崎病学会・学術集会。）
234.	2013/09	川崎病様症状からショック状態となりTSSとの鑑別に苦慮した12歳男児の1例。（第33回日本川崎病学会・学術集会。）
235.	2013/09	馬パラチフス菌の全ゲノム塩基配列。（第156回日本獣医学会学術集会。）
236.	2013/06	カポジ肉腫関連ヘルペスウイルス（KSHV/HHV-8）関連疾患におけるウイルスmiRNAの発現。（第102回日本病理学会総会。）
237.	2013/05	SNPs解析により示されたらい菌日本株ゲノムの特徴。（第86回日本ハンセン病学会。）
238.	2013/03	アメーバ共生難培養性細菌原始クラミジアの比較ゲノム解析。（第86回日本細菌学会）
239.	2013/03	オウム病クラミジア特異的および動物クラミジアを広範に検出するLAMP法の開発。（第86回日本細菌学会）
240.	2013/03	メタゲノム解析の臨床応用と病原体候補の推定。（第86回日本細菌学会）
241.	2013/03	メタゲノム解析の臨床応用と病原体候補の推定。（第86回日本細菌学会）
242.	2013/03	我が国において流行を示すCampylobacter jejuni ST-4526のゲノム特性。（第86回日本細菌学会）
243.	2013/03	小児脳膿瘍から分離されたStreptococcus intermedius TYG1620のゲノム解析。（第86回日本細菌学会）
244.	2013/03	新規Enterobacter sp.のゲノム解読と染色体性ß-lactamase blaMIR-KINANの解析。（第86回日本細菌学会）
245.	2013/03	糞便メタゲノム解析による大腸菌のポピュレーション解析。（第86回日本細菌学会）
246.	2012/10	ヒト・家畜・食品由来のESBL産生菌の変遷と世界各国の疫学状況。（第５９回日本化学療法学会東日本支部総会）
247.	2012/10	ヒト・家畜・食品由来のESBL産生菌の変遷と世界各国の疫学状況。（第５９回日本化学療法学会東日本支部総会）
248.	2012/10	川崎病患児におけるフローラの経時的変動解析。（第３２回川崎病学会）
249.	2012/10	喀痰からCedeceaspeciesが検出され，ゲノム解析から起炎菌は Enterobacter speciesであった肺炎の一例。（感染症学会東日本地方会）
250.	2012/08	ナホシクドアの退化したミトコンドリアゲノムが明らかにする、ミクソゾアの左右相称動物起源。（日本進化学会第１４回大会）
251.	2012/08	パレコウイルス3型による成人の筋痛症の流行。（第６６回日本細菌学会東北支部総会）
252.	2012/06	Kyoto-2株の全ゲノムシーケンスにより同定されたSNPs解析。（第85回日本ハンセン病学会総会・学術大会）
253.	2012/06	パレコーウイルス3型による成人の筋痛症の流行。（第５３回臨床ウイルス学会）
254.	2012/03	Deep sequencingで得られた解読リードの各種解析法。（第85回日本細菌学会）
255.	2012/03	Deep sequencing法による野兎病菌Francisella感染症の腋窩部膿瘍の網羅的病原体検索。（第85回日本細菌学会）
256.	2012/03	国内初のNDM-1陽性大腸菌ST38分離株のblaNDM-1陽性IncA/Cプラスミドの完全長配列と植物病原細菌との関連性。（第85回日本細菌学会）
257.	2011/12	Campylobacter jejuni国内分離株の遺伝学的多様性。（第4回日本カンピロバクター研究会）
258.	2011/09	A comprehensive and quantitative 16S ribosomal DNA deep-sequencing analysis for microbiota using next-generation sequencer.（IUMS 2011）
259.	2011/09	Whole-genome analysis of Salmonella enterica serovar Typhimurium T000240 reveals the acquisition of a genomic island involved in multidrug resistance via IS1 derivatives on the chromosome.（IUMS 2011）
260.	2011/07	KSHVがコードしている16 baseのunusual small RNAの発現。（第8回EBウイルス研究会）
261.	2011/07	動物腸管内の原生動物に内在する細菌と細菌叢と原生動物叢の共生関係。（第80回日本寄生虫学会）
262.	2011/05	A Comprehensive And Quantitative 16S rDNA Deep-sequencing Analysis For Microbial Flora Using Next-generation Sequencer.（111th American Society for Microbiology）
263.	2011/05	Characterization of Quasispecies of Pandemic 2009 Influenza A Virus (A/H1N1/2009) by de novo Sequencing using a Next-generation DNA Sequencer.（111th American Society for Microbiology）
264.	2011/04	マダニ媒介性の新型ボレリアBorrelia turcica の比較ゲノム解析。（第63回日本衛生動物学会）
265.	2011/03	次世代シークエンサーによるパンデミック・インフルエンザウイルスA/H1N1/2009 の多種性解析。（第151回日本獣医学会学術集会）
266.	2011/02	腸炎起病性菌のゲノム解析の現状と今後の展望。（第4回日本カンピロバクター研究会）
267.	2010/12	Francisella tularensis subspecies tularensis SCHU株の強毒性に関わる遺伝子の同定。（BMB2010 第３３回分子生物学会年会）
268.	2010/12	次世代シークエンサーによるパンデミック・インフルエンザウイルスA/H1N1/2009 の多種性解析。（BMB2010 第３３回分子生物学会年会）
269.	2010/12	次世代シークエンサーを用いた16S rDNA配列解読による網羅的且つ定量的な腸内細菌叢解析。（BMB2010 第３３回分子生物学会年会）
270.	2010/10	次世代シークエンサーによる川崎病の病原体候補カタログの作製。（第30回日本川崎病研究会）
271.	2010/10	次世代シークエンサーによる網羅的且つ定量的なヒト腸内細菌叢解析。（第93回日本細菌学会・関東支部会）
272.	2010/06	次世代シークエンサー網羅配列解読法による川崎病の病原体候補カタログの作製。（第26回関東川崎病学会）
273.	2010/04	ウイルスの網羅的解析による川崎病の原因究明（第113回日本小児科学会学術集会）
274.	2010/04	次世代シークエンサーによる川崎病の原因究明（第113回日本小児科学会学術集会）
275.	2010/04	次世代シークエンサーによる川崎病の原因究明。（第113回日本小児科学会学術集会）
276.	2010/03	illumina GAIIによる16SrDNA配列を用いた網羅的且つ定量的な細菌叢解析。（第83回日本細菌学会・総会）
277.	2010/03	全ゲノム解読による炭疽菌・キノロン耐性領域の探索。（第83回日本細菌学会・総会）
278.	2010/03	炭疽菌病原プラスミドにコードされる分泌タンパク質の培養細胞への影響（第83回日本細菌学会・総会）
279.	2009/11	全ゲノム解読による炭疽菌・キノロン耐性領域の探索。（第92回日本細菌学会・関東支部会。）
280.	2009/10	フィリピンにおける狂犬病ウイルスの分子疫学的検討。（第５７回日本ウイルス学会学術集会）
281.	2009/10	川崎病の原因究明－I. ウイルスの網羅的解析。（第29回日本川崎病研究会）
282.	2009/10	川崎病の原因究明－II. 次世代シークエンサーによる網羅的解析。（第29回日本川崎病研究会）
283.	2009/10	川崎病の原因究明－III.プロテオーム解析法を用いた患者血清の網羅的解析。（第29回日本川崎病研究会）
284.	2009/08	Discovery of secondary metabolite biosynthetic genes in Nocardia brasiliensis by genome scanning with next generation sequencer.（The 15th International Symposium on the Biology of Actinomycetes (ISBA’15).）
285.	2009/03	セレウスグループに属する各菌種におけるSNPの網羅的探索と種間比較におけるその利用。（第８２回日本細菌学会総会）
286.	2009/03	黄色ブドウ球菌のSarAパラログによる細胞壁架橋型タンパク質SasG の転写制御の解析。（第８２回日本細菌学会総会）
287.	2009/03	次世代シークエンサーによるNocardia terpenicaのゲノム解析の試み。（第３回ゲノム微生物学会年会）
288.	2009/03	動物腸管内の細菌叢および原生動物叢の検出・同定。（第８２回日本細菌学会総会）
289.	2009/03	日本で分離された炭疽菌の分子遺伝学的解析。（第８２回日本細菌学会総会）
290.	2008/09	細胞壁架橋型タンパク質Staphylococcus aureus surface protein G (SasG) による自己複合体形成と菌凝集能。（第５３回ブドウ球菌研究会）
291.	2008/06	Methicillin-Resistant Staphylococcus saprophyticus Carrying Staphylococcal Cassette Chromosome mec (SCCmec) Have Emerged in Urogenital Tract Infections.（108th ASM general meeting.）
292.	2008/03	βラクタム剤耐性Staphylococcus saprophyticusの新規SCCmec構造。（第81回日本細菌学会総会）
293.	2007/09	In vivo expression of cell surface proteins in Staphylococcus aureus.（Gordon Research Conference, staphylococcal diseases.）
294.	2007/09	In vivo expression of cell surface proteins in Staphylococcus aureus.（Gordon Research Conference, staphylococcal diseases.）
295.	2007/05	Sanae Nagasaki and Toshiko Ohta. Sesquiterpene Farnesol Affects Lipase Activity of Staphylococcus aureus as a Competitive Inhibitor.（107th ASM general meeting.）
296.	2007/05	Staphylococcus aureus surface protein SasG contributes to intercellular adhesion and biofilm formation.（107th ASM general meeting.）
297.	2007/03	（W5. 近縁ゲノム配列比較から病原性へ）比較ゲノム解析から見えるブドウ球菌属の種特徴的な病原性と生存機構。（第80回日本細菌学会総会）
298.	2007/03	黄色ブドウ球菌・細胞壁架橋型タンパク質SasGによるバイオフィルム形成能。（第80回日本細菌学会総会）
299.	2007/03	黄色ブドウ球菌の超巨大蛋白質Ebhによる耐塩機構の解析。（第80回日本細菌学会総会）
300.	2007/03	精油テルペノイドFarnesolが有する黄色ブドウ球菌の薬剤感受性増強メカニズムの解析。（第80回日本細菌学会総会）
301.	2006/10	精油テルペノイド・Farnesolが有する黄色ブドウ球菌の薬剤感受性増強および毒素活性の抑制。（第89回日本細菌学会関東支部会）
302.	2006/09	SarAホモログであるSarT、SarU過剰発現による細菌凝集塊形成。（第51回日本ブドウ球菌研究会）
303.	2006/09	Sesquiterpene Farnesol Increases the Susceptibility to beta-Lactams due to the Inhibition of Lipid Carrier Synthesis in Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus.（46th ICAAC annual meeting.）
304.	2005/09	腐性ブドウ球菌Staphylococcus saprophyticus ATCC15305株のゲノム配列と尿路病原因子の特定（第50回日本ブドウ球菌研究会）
305.	2005/06	Complete Genome Sequence of Uropathogenic Bacteria Staphylococcus saprophyticus.（105th ASM general meeting）
306.	2005/06	Evaluation of a cefoxitin 30 µg disc diffusion test for detection of the mecA-positive methicillin-resistant Staphylococcus saprophyticus.（105th ASM general meeting）
307.	2005/04	尿路感染症を引き起こす腐性ブドウ球菌Staphylococcus saprophyticusのゲノム構造と定着・生存機構（第78回日本細菌学会総会）
308.	2004/09	泌尿器から臨床分離された腐性ブドウ球菌Staphylococcus saprophyticusの疫学的調査と薬剤耐性動向（第49回日本ブドウ球菌研究会）
309.	2004/09	腐性ブドウ球菌Staphylococcus saprophyticus ATCC15305株の莢膜生合成オペロンの遺伝子構造とその欠損株の性状（第49回日本ブドウ球菌研究会）
310.	2004/08	Genome Structure of Uropathogenic Staphylococcus saprophyticus　Molecular Genetics of Bacteria & Phages, CSHL, 2004 Aug.
311.	2004	Frequent Acquisition of Methicillin-Resistance in Clinical Isolates of Uropathogenic Staphylococcus saprophyticus, and structure of its mecA region. Molecular Genetics of Bacteria and Phages meeting 200 Aug.CSHL
312.	2002/04	Analysis of hetero-VRSA strain Mu3.（第75回日本細菌学会総会）
313.	2002/04	マイクロアレイを用いた黄色ブドウ球菌の抗生物質の応答解析。（第75回日本細菌学会総会）
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■ 受賞歴

1.	2006/03	日本細菌学会　日本細菌学会黒屋奨学賞
2.	2006/01	つくば医科学研究会　つくば医科学奨励賞

■ 受託研究・競争的資金

1.	2022/04～2024	わが国の病原体検査の標準化と基盤強化、ならびに、公衆衛生上重要な感染症の国内検査体制維持強化に資する研究競争的資金等の外部資金による研究
2.	2022/04～2024	病原体ゲノム情報サーベイランスを基盤とした公衆衛生対策への利活用に係る研究競争的資金等の外部資金による研究
3.	2021/04～2023	環境中における薬剤耐性菌及び抗微生物剤の調査法等の確立のための研究競争的資金等の外部資金による研究
4.	2021/04～2023	結核対策困難化要因に対する総合的基礎研究競争的資金等の外部資金による研究
5.	2021/04～2023	新型及び季節性インフルエンザに係る流行株の予測等に資するサーベイランス及びゲノム解析に関する研究競争的資金等の外部資金による研究
6.	2020/04～2022	環境中の薬剤耐性菌のモニタリングによる院内感染リスクの早期探知と環境負荷軽減策の開発に係る研究競争的資金等の外部資金による研究
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社会活動・地域貢献

■ 所属学会

1.		日本化学療法学会
2.		日本感染症学会
3.		日本細菌学会
4.	2015/04～2020/03	∟ M&I 編集委員会委員
5.		日本小児科学会
6.		日本分子生物学会
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■ その他

2017/02～2024/03

厚労省・薬剤耐性ワンヘルス動向調査検討会委員

メッセージ

■ 研究紹介

順天堂大でMRSAゲノム解析、国立感染症研究所で多様な病原体のゲノム情報解析に従事しました。個々の分離株の特徴を深堀りしたり、複数株の比較ゲノム解析から株固有の特徴を解明したり、感染症疑い症例のNGS診断も多数実施しています。本学において、臨床検体から分離・同定・ゲノミクス・情報解析までいっきに完遂できる人材を育成し、ゲノミクス研究の促進を図っていきます。